【研究背景】
隨著全球工業(yè)化進程的加速,大量工業(yè)化學品的使用導致了許多具有不明毒理學特性的環(huán)境污染物的出現(xiàn)。這些污染物往往會影響生物體內(nèi)多種生物分子調控的網(wǎng)絡通路,而傳統(tǒng)的毒理學測試方法通常忽略這些復雜的影響。因此,如何快速、全面且高效地評估環(huán)境中潛在有毒物質的毒性成為一個重大挑戰(zhàn)。本文研究聚焦于二丁基二月桂酸錫(DBTDL),這是一種廣泛應用于工業(yè)中的有機錫化合物,盡管其毒性低于三丁基錫,但關于其對神經(jīng)系統(tǒng)尤其是腦部的毒性作用仍研究不足。研究結合網(wǎng)絡毒理學和分子對接方法,旨在識別DBTDL誘導腦損傷的分子靶標并闡明其潛在機制。
【研究方法】
? 數(shù)據(jù)庫篩選:通過ChEMBL和STITCH數(shù)據(jù)庫檢索與DBTDL相關的靶點,并利用GeneCards和OMIM數(shù)據(jù)庫檢索與腦損傷相關的靶點。通過Venn圖分析,確定DBTDL與腦損傷的共同靶點。
? 網(wǎng)絡構建與核心靶標篩選:將篩選出的靶點提交至STRING數(shù)據(jù)庫,構建蛋白質相互作用(PPI)網(wǎng)絡,并通過Cytoscape軟件進行可視化分析。基于網(wǎng)絡拓撲學參數(shù)(如介數(shù)中心性、接近中心性等),篩選出24個核心靶標。
? 功能與通路富集分析:利用DAVID和FUMA數(shù)據(jù)庫,對143個潛在靶標進行基因本體(GO)和京都基因與基因組百科全書(KEGG)富集分析,揭示其生物學功能和相關信號通路。
? 分子對接實驗:從RCSB蛋白數(shù)據(jù)庫獲取核心靶標的晶體結構,使用AutoDock Vina進行分子對接,預測DBTDL與核心靶標的結合模式和結合能。
? 體外實驗驗證:采用人小膠質細胞(HMC3)和人腦微血管內(nèi)皮細胞(HBMEC)進行細胞毒性實驗,檢測DBTDL對細胞增殖、活性氧(ROS)水平以及核心靶標和神經(jīng)營養(yǎng)因子表達的影響。
【研究結果】
1.靶標識別與篩選結果:共識別出143個與DBTDL暴露和腦損傷相關的潛在靶標,并篩選出24個核心靶標。這些靶標涉及信號轉導、突觸功能、激素調節(jié)和炎癥反應等多個關鍵生物學過程。
2. 分子對接結果:分子對接實驗顯示,DBTDL與五個核心靶標(AGT、AGTR1、GNB1、GNG2和POMC)具有較強的結合能力,結合能分別為?7.8 (AGT), ?9.9 (AGTR1), ?11.2 (GNB1), ?6.7 (GNG2)和 ?3.7 (POMC) kcal/mol。這表明DBTDL可以自發(fā)地與這些靶標結合,可能通過干擾其正常功能而引發(fā)腦損傷。
3. 核心靶標的功能分析:對24個核心靶標的功能進行詳細分析,發(fā)現(xiàn)它們在神經(jīng)信號傳導、炎癥反應和激素調節(jié)中發(fā)揮重要作用。例如,AGT和AGTR1參與血壓調節(jié)和血管收縮,GNB1和GNG2與G蛋白信號通路相關,POMC則與激素合成和神經(jīng)肽信號傳導密切相關。
4. 信號通路分析:通過KEGG通路分析,揭示了DBTDL可能通過影響神經(jīng)活性配體-受體相互作用、鈣信號通路、cAMP信號通路等關鍵信號通路而引發(fā)腦損傷。
5. 體外實驗驗證結果:
(1)細胞毒性實驗:DBTDL在0.1到20 μM濃度范圍內(nèi)對HMC3和HBMEC細胞表現(xiàn)出顯著的細胞毒性,抑制細胞增殖,并呈現(xiàn)劑量依賴性。
(2)ROS水平檢測:DBTDL處理后,兩種細胞內(nèi)的ROS水平顯著增加,表明DBTDL可能通過誘導氧化應激反應而對細胞造成損傷。
(3)基因表達分析:經(jīng)DBTDL處理后,五個核心靶標(AGT、AGTR1、GNB1、GNF2、POMC)的表達水平顯著上調,同時神經(jīng)營養(yǎng)因子BDNF和NT3的表達也有所增加,這可能反映了細胞對損傷的代償性反應。
【研究結論】
本研究通過網(wǎng)絡毒理學和分子對接方法全面探討了DBTDL的潛在腦毒性,識別了143個相關潛在靶標和24個核心靶標,并驗證了DBTDL與五個核心靶標的強結合能力。體外實驗表明DBTDL通過激活氧化應激通路抑制細胞增殖并誘導細胞毒性,同時上調核心靶標和神經(jīng)營養(yǎng)因子的表達。研究結果不僅增進了對DBTDL誘導腦損傷機制的理解,還預測了重要的調控靶標,為制定更嚴格的DBTDL暴露限值和生物監(jiān)測計劃提供了科學依據(jù),并強調了開發(fā)針對DBTDL的螯合劑以提供神經(jīng)保護的必要性。研究創(chuàng)新性地將網(wǎng)絡毒理學與分子對接相結合,為評估環(huán)境污染物的毒理學效應提供了新途徑。
Hao M, Shi N, Zhao Y, Chen J. Investigating the potential molecular mechanisms of dibutyltin dilaurate induced brain injury: a network toxicology and molecular docking approach. Environ Pollut. 2025 Sep 15;381:126642. doi: 10.1016/j.envpol.2025.126642. Epub 2025 Jun 9. PMID: 40499775.
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